| 部门 | 品级 | 官职 | 说明 | 任命 | | 三大营 | 【应天营】应天府内都城第一大营，驻于金陵城西，安德门外。兵力约10万人。 | | 正二品 | 大将/都指挥使 | 设1人，最高长官，总管卫所事务，统率全卫官兵。 | | | 从二品 | 副将/副指挥使 | 设2人，协助指挥使管理卫所。 | | | 正三品 | 参将 | 设1人，分管训练、军纪等具体事务。 | 沈介（已故） | | 从三品 | 游击将军 | 设1人，负责监管、刑狱。 | | | 正五品 | 副营 | 设2人，领千户所，负责重大案件侦缉。 | 陈济 | | 正六品 | 把总 | 设5人，领百户所，执行具体任务。 | | | 【神枢营】骑兵与机动部队，以精锐骑兵为主，兼具机动突击、侦察、巡逻等任务，兵力约7万人。 | | 内臣 | 提督 | 设1人，无实职。 | | | 正二品 | 大将 | 设1人，精锐骑兵，仪仗扈从。 | | | 【神机营】火器精锐，装备火铳、火炮等先进火器，兵力约6万人。 | | 内臣 | 提督 | 设1人，无实职。 | | | 正五品 | 把总 | 设3人，配备火铳、火炮，火器训练。 | | | 地方营 | 其余州府直属营，驻守州府，可做战时机动调遣。每营约1千-3千人。 | | 正三品 | 大将 | 设1人，州府最高军事长官，总管卫所事务，统率全卫官兵。 | | | 从三品 | 副将 | 设2人，协助指挥使管理卫所。 | | | 正四品 | 指挥佥事 | 设1人，分管训练、屯田等具体事务。 | | | 正五品 | 千户 | 设1人，统辖一千户所。 | | | 从五品 | 副千户 | 设2人，协理。 | | | 正六品 | 百户 | 设3人，统辖一百户所。 | | | 边疆 | 九边重镇、东北疆、西南疆驻军。每镇总兵力约数万至十万人，分属多个营。 | | 正一/从二品 | 总兵 | 设1人，多挂将军印，如"征虏前将军"。 | | | 从二品 | 副总兵 | 设2人，协防。 | | | 正三品 | 参将 | 设1人，分守要隘。 | | | 从三品 | 游击将军 | 设1人，机动支援。 | | | 内臣 | 镇守太监 | 设1人，皇帝耳目，监督边镇。 | | | 正一品 | 督师 | 设1人，战时统辖多镇。 | | | 正三品 | 锦衣卫指挥使 | 直辖皇帝，掌情报、仪仗 | | | 陇山军 | 先称谢家军，后太祖赐名陇山军，驻地在金陵城北，神策门外外玄武湖西北，设"陇山大营"。约3万人。边疆约30万。 | | 正二品 | 大将/都指挥使 | 设1人，全军统帅，世袭。 | 谢煦 | | 正三品 | 副将/副指挥使 | 设1人，主管军法、作训，掌骑兵步兵。 | | | 正四品 | 指挥同知 | 设1人，协助副将，处理日常政务、作训机要。 | 谢庭昀 | | 从四品 | 佥事 | 设1人，负责后勤事务。 | | | 从五品 | 镇抚使 | 设1人，军纪监察，直属兵部。 | | | 正六品 | 总旗 | 每百户所2名，领56人 | | | 正七品 | 小旗 | 每总旗下设5名，领11人 | | | 正七品 | 经历 | 设1人，文书档案，文官。隶属五军都督府。 | | | 正八品 | 都事 | 设1人，军饷核算，文官。隶属兵部。 | | | 从九品 | 医官 | 设5人，战伤救治，文官。隶属太医院。 | |
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